Det franske mesterlaget vant med samme sifre i San Sebastian og gjorde dermed jobben grundig da de som første lag greide å slå en spansk klubb ut av europacupen denne sesongen.
Spania hadde alle sine fire deltakere med til åttedelsfinale i mestercupen, og har også alle fire med til åttedelsfinale i UEFA-cupen.
Hvor vanskelig de spanske lagene er å tukte, fikk fjorårsfinalist Juventus erfare tirsdag da de hjemme i Torino gikk på sitt annet 0-1-tap mot Deportivo La Coruna.
For Real Sociedad var det ingen redning. Etter en famlende åpning spilte Lyon seg opp og koblet grep om kampen, og avgjørelsen falt da Juninho i det 77. minutt scoret et fortjent vinnermål.
Brasilianeren ble spilt fram av Peguy Luyindula og scoret stolpe-inn fra kort hold.
Det var en seier som kostet. Keeper Gregory Coupet måtte ut med skade etter at han i åpningsminuttene modig kastet seg i beina på Igor Gabilondo, som tråkket ham hardt på hånden. Den franske landslagsmannen kan miste resten av turneringen på grunn av skaden.
Bjørn Tore Kvarme var vraket i Real Sociedads lag tirsdag og satt heller ikke på benken.