Tidligere denne sesongen har City nærmest vært umulig å slå på hjemmebane.
Bayern München (3-1 i mesterligaen), Chelsea (1-0 i ligaen) og Barcelona (2-0 i mesterligaen) var før søndagens kamp de eneste som har reist hjem fra den blå delen av Manchester med seier i bagasjen.
Katastrofale forsvarstabber gjorde jobben lettere for Wigan. I første omgang var Martín Demichelis på foten til Marc-Antoine Fortune, som gikk i bakken. Spanjolen Jordi Gómez var sikker fra straffemerket.
Clichy-tabbe
Gjestene fra mesterskapsserien gikk til pause med ledelse, og det tok ikke lange tiden før Wigan doblet.
Et lavt innlegg fra venstre, forbi hele City-forsvaret, fant James Perch på bakre stolpe. Han dro nytte av en uoppmerksom Gaël Clichy og økte til 2-0. Da var det bare spilt to minutter av annen omgang.
Manuel Pellegrini viste sin misnøye og gjorde tre bytter etter 52 minutter. Blant dem Edin Dzeko inn for Alvaro Negredo. Det ga nesten redusering 12 minutter senere. Dzeko dro seg fri på bakre stolpe, men headingen gikk i stolpen. Derfra og inn skapte Wigan lite, mens City skapte mye.
Etter 68 minutter prøvde Samir Nasri seg fra 18 meters hold. Kula stusset i gresset og gled pent inn i hjørnet bak Scott Carson.
Holdt unna for enormt press
De siste tjue minuttene var et endeløst mareritt for både Wigan-forsvaret og City-angrepet. For hjemmelaget presset voldsomt, men slet med å få uttelling.
Sergio Agüero og nevnte Dzeko var blant dem som fikk flere forsøk på å sette ballen i mål, men som ikke lyktes.
Dermed ble Wigan det første laget fra mesterskapsserien som har vunnet på Manchester Citys hjemmebane siden Nottingham Forest gjorde det i 2009.
Wigans skalp mot City kan gi kjærkommen selvtillit videre i turneringen. I semifinalen på Wembley i april venter Arsenal for Uwe Röslers menn. Hull og Sheffield United er de øvrige semifinalistene.