Fjorårets mestercupfinalist må vinne sine to siste kamper.
Først borte mot Deportivo La Coruna neste tirsdag før Lens må beseires hjemme på Olympiastadion 13. november. Samtidig må det spanske laget ikke ta flere poeng.
Milan er som det tredje laget klar for mellomspillet fra gruppe G. De tok ledelsen ved brasilianeren Serghino etter 10 minutters spill, Michael Tarnat utlignet etter 23 minutter.
Men etter 64 minutter slo den italienske måltjuven Filippo
Inzhagi til og gjorde 2-1 for Milan med sitt sjuende mål i årets mesterliga. Like etter pause måtte Bayerns målvakt, Oliver Kahn ut med en skade.
Han ble erstattet av Stefan Wessels, som for øvrig var sjanseløs på skuddet til Inzaghi.