Ifølge nyhetsbyrået AP skal Inter-fansen ha viftet med oppblåsbare bananer og kommet med rasistiske tilrop mot sin tidligere helt.
Les om kampen: Uavgjort i Milan-derbyet
Balotelli, som har ghanesiske røtter, spilte sin første kamp mot gamleklubben etter overgangen fra Manchester City til Milan i januar.
Ifølge ulike medier svarte Balotelli kun med å plassere en finger foran munnen for å hysje supporterne.
– Balotelli var flink som unnlot å reagere på tilropene. Det var mest synd at han ikke scoret. La oss ikke glemme at han er 22 år og møtte sin gamle klubb. Det er klart han kjente presset, sier Milan-trener Massimiliano Allegri.
Den tidligere City-spissen noterte tre enorme målsjanser i kampen, men maktet ikke å score i en kamp som til slutt endte 1-1.
Balotelli spilte fire sesonger for Inter, og var med å hjelpe klubben til tre seriemesterskap.