Det internasjonale fotballforbundet, FIFA, avgjør nå om - og eventuelt hvordan - Egypt skal straffes for det som skjedde.
Dermed er stemningen ytterligere opphetet foran den avgjørende VM-kvalifiseringskampen mellom Egypt og Algerie lørdag kveld.
Kampen er helt avgjørende for hvilket av de to landene som får være med i neste års fotball-VM i Sør-Afrika.
Artikkelen fortsetter under videoen.
Se de dramatiske bildene.
"Algirerne gjorde det selv"
Rundt 200 ungdommer var samlet foran hotellet der det algeriske landslaget skal bo, og angrep bussen med steiner da den kom fra flyplassen torsdag kveld.
Egypts største avis, den statlig eide Al-Ahram, skriver fredag at det var de algeriske spillerne selv, ikke egyptisk steinkastere, som hadde foråsaket skadene på bussen og spillerne.
- Noen av spillerne begynte å knuse bussens vinduer, og påstod at de var angrepet av steinkastere, skriver avisa.
Den uavhengige avisa Al-Masri Al-Yom går et hakk videre og skriver at hele hendelsen var "helt oppkonstruert".
"Vunduene var knust fra innsiden", skriver avsa, og siterer en sikkerhetskilde.
En tredje avis skriver at spillerne også skal ha angrepet bussjåføren.
Forskrekket
- Dette er en meget beklagelig hendelse, sier Algeries sportsminister Hachemi Djiar. Han legger til at FIFAs representanter på kampen er kjent med det som skjedde. Landets utenriksminister Majid Bouguerra sier han er forskrekket.
Hendelsen er så langt ikke kommentert av egyptiske myndigheter eller fotballedere, men Bouguerra hadde et møte med Egypts ambassadør i Algerie etter hendelsen.
- Bouguerra krevde at egyptiske myndigheter gjør alt som er nødvendig for sikkerheten til hele den algirske delegasjonen og for alle tilreisende supportere fra Algerie.
Alarmberedskap
Politiet er i alarmberedskap foran kampen, som allerede i lengre tid har ført til kraftig ordbruk mellom de to lands fotballtilhengere på nettet og i andre medier.
- Les:
- Les:
Egypt er regjerende afrikansk mester, og skuffelsen i landet kommer til å bli enorm hvis de ikke kvalifiserer seg til VM for første gang siden 1990.
Da kvalifiserte de seg med 1-0 i den avgjørende kampen over nettopp Algerie, ble det mye bråk og uroligheter etter kampen.
For å gå til VM denne gangen, må de slå Algerie med minst to mål lørdag. Hvis ikke, tar Algerie VM-plassen.
