Mens seks lagkamerater plasserte seg på plassene 18 til 23 i sammendraget, 22 sekunder bak lederen, er nordmannen helt nede på 135.-plass med to minutter svakere tid.
– Det var ikke akkurat som forventet. Jeg hadde håpet å være med gutta til mål, men det var en tøff start, og jeg har bare trent på temposykkelen de siste dagene, sa Boasson til TV 2.
Han deltar i sitt første ritt siden han brakk kragebeinet i Tour de France.
Astana var best på den innledende etappen og vant med 10 sekunder til gode på Radioshack. Sloveneren Janez Brajkovic var første Astana-rytter over mål og blir den første som får kjøre i den røde ledertrøyen i årets ritt.
– Vi kjørte sterkt. Det gjorde veldig vondt der ute, men sånn skal det være, sa Brajkovic' lagkamerat, danske Jakob Fuglsang til dansk TV 2.
Det setter italienske Vincenzo Nibali i en god posisjon foran resten av løpet. Astana-rytteren er en av favorittene til å vinne sammenlagt, når rittet avsluttes om tre uker.
Radioshack trillet over mållinjen ti sekunder bak Astanas vinnertid. Bak Radioshack fulgte Omega-QuickStep, Sky og Movistar.
Rittet fortsetter søndag med en 179 kilometer lang etappe fra Pontevedra til Alto Do Monte Da Groba. Etappen er noe kupert.
1. Astana 29:59"
2. RadioShack +10"
3. Omega Pharma - Quick-Step +16"
4. Team Sky +22"
5. Movistar +29"
6. Saxo - Tinkoff +32"
7. NetApp +35"
8. BMC Racing +36"
9. Orica +45"
10. Belkin +49"
