Danske Michael Rasmussen, søndagens vinner, ble nummer tre og Fransico Mancebo fra Spania nummer fire. Disse fire utgjorde tetgruppa i den siste mila av stigningen opp mot mål i Courchevel.
Armstrong, som er på jakt etter sin sjuende strake seier i Tour de France, hadde full kontroll over sine konkurrenter, til tross for at han ikke vant etappen.
Men amerikaneren tok tilbake ledertrøya som han mistet på søndag. Rasmussen er nå på andreplass, 38 sekunder etter amerikaneren.
Sprengte feltet
Etappen ble avsluttet med en 28 km lang stigning, der den ene etter den andre av favorittene måtte slippe. Feltet ble sprengt i småbiter da Armstrong satte opp farten oppover bakkene, og tidsforskjellene i den første skikkelig tøffe Alpe-etappen ble store.
Alejandro Valverde fra Iles Baleares slo Armstrong i spurten (Foto: Joel Saget, AFP)
Men spanske Alejandro Valverde klarte han ikke å riste av seg, og 50 m før mål smatt Iles Baleares-rytteren forbi og knep etappeseieren.
En av forhåndsfavorittene, 1997-vinner Jan Ullrich, holdt følge til det gjenstod en mil. Derfra og inn tapte han nesten to og et halvt minutt. Aleksandre Vinokourov, en annen av favorittene, tapte mer enn fem minutter i etappens sluttfase.
Fra ledelse til 72. plass
Jens Voigt syklet i den gule trøya etter å ha starte dagen som leder. Men han kom i mål over en halv time etter vinneren og raste helt ned til en 72. plass på sammenlagtlista.
Etappen var 181 km og gikk fra Grenoble til Courchevel.
Thor Hushovd og Kurt Asle Arvesen måtte slippe allerede i den første skikkelige stigningen etter om lag 80 km.
Håpet på poeng
Hushovd hadde håpet å kjempe om poeng i den første innlagte spurten. Men da hadde en utbrytergruppe på sju ryttere allerede flere minutters ledelse, og Hushovd var sjanseløs. Seinere hadde begge de to norske nok med å komme seg til mål innen tidsfristen, for i det hele tatt å få lov å være med i touren videre.
Det klarte de. Begge kom i mål 38 minutter og 11 sekunder etter Valverde. Arvesen ble nummer 152 og Hushovd 165 av de 174 som fortsatt er med.