Brannmannen fikk deler av tak- og veggkonstruksjonen fra garasjen han skulle slokke over seg.
Han ble hentet av et Sea King redningshelikopter og fløyet til Ullevål sykehus i Oslo.
Det er ikke meldt om andre skadde.
Brannen skjedde i Øbergveien øst for Halden sentrum.
– Vi vet foreløpig ikke om det sto noen biler i garasjen. Det pågår nå etterslokking, og så snart branntomta er kald, vil det bli foretatt branntekniske undersøkelser, sier operasjonsleder Terje Norang i Øst politidistrikt til NTB.
Politiet fikk melding om brannen klokka 3.49 natt til søndag.
Alle nødetatene rykket ut, og i alt 14 beboere i nabohus ble evakuert.
Brannmannskapene hadde kontroll over ilden etter forholdsvis kort tid, men det meldes at garasjen er helt nedbrent.