Utskiftningen skjedde uten forvarsel onsdag. Avisen har ikke gått ut med bakgrunnen for redaktørbyttet.
Ifølge avisen The New Yorker konfronterte Abramson sin arbeidsgiver, etter å ha funnet ut at hennes mannlige forgjenger Bill Kelner tjente mer enn henne – både i jobben som sjefredaktør og i hennes tidligere jobb som redaksjonssjef.
Flere i ledelsen skal ha sett på Abramson som litt for pågående og freidig, og lønnskonfrontasjonen skal derfor ikke ha falt i god jord, ifølge avisens ikke navngitte kilder.
– Det er uklart om hun hoppet av eller ble dyttet ut, men det lille vi vet antyder det siste, sier tidligere avisredaktør Alan Mutter.
Abramson forlot avisen uten å si farvel til staben, men skriver i en uttalelse at hun elsket jobben.
En talsperson for New York Times sier lønnen og pensjonsordningene til Abramson og Kelner var sammenlignbare, men ikke like. Forskjellene skal blant annet skyldes at Kelner hadde lengre ansiennitet i avisen.
Abramsons etterfølger er Dean Baquet (57). Baquet kommer fra jobben som redaksjonssjef i avisen.