Kayser var en av seks fra Kompani Linge som i 1943 sprengte tungtvannsfabrikken på Rjukan. Sabotasjeaksjonen regnes som en av krigens viktigste på norsk jord, ettersom den hindret tyskernes arbeid for å fremstille atombomber.
- Han har hatt skrantende helse de siste fire månedene, og han sovnet inn i halv fem-tiden i ettermiddag, sier sønnen Jan Fredrik Kayser til .
Sentral i Bjørn West
Fredrik Torbjørn Kayser deltok i kampene etter 9. april 1940, og dro deretter til England, hvor han ble medlem av Kompani Linge. Mot slutten av krigen var han nestkommanderende i motstandsgruppen Bjørn West, som kjempet mot tyskerne i Matre-fjellene i Masfjorden i Hordaland.
Bergenseren spilte seg selv i den første filmen om tungtvannsaksjonen, noe de øvrige medvirkende også gjorde.
Høyt dekorert
Kayser ble etter krigen dekorert med St. Olavsmedaljen med ekegren to ganger, samt Æreslegionen.
Kompani Linge ble offisielt nedlagt på Akershus festning i oktober 2007