Thomsen gir seg med øyeblikkelig virkning som følge av intern uenighet om klubbens strategi og ledelse, opplyser FCM i en pressemelding mandag.
– Etter en rekke gode år med fine sportslige resultater, først som assistenttrener og siden hovedtrener, har de siste månedene bydd på ulike oppfatninger av FCM Håndbolds framtidige strategi og ledelse, heter det i meldingen.
– Derfor har klubbens ledelse og Helle Thomsen valgt å skille lag, sier sportsdirektør Stefan Kristensen videre.
Thomsen har trent Midtjylland de fire siste sesongene.