Det er også hørt skudd inne fra flybasen. Minst fem personer er drept, melder Sky News.
Pakistanske myndigheter omtaler hendelsen som et terrorangrep. Flybasen brukes av marinen og ligger i Karachi, Pakistans største by.
Mellom 15 og 20 gjerningspersoner deltok i angrepet på Merhan-basen. Angriperne skjøt også mot sikkerhetsstyrkene ved basen.
– Vi kan bekrefte at terrorister har angrepet flybasen, og at fire mennesker er drept, sa en talsmann.
– Antallet drepte kan stige, la han til.
Klokken 22 norsk tid pågikk aksjonen fortsatt. BBC melder at gjerningsmennene tok flere gisler på flybasen. Ingen har til nå tatt på seg ansvaret for angrepet.
Fly ødelagt
Terroristene gikk til angrep på flyhangerne med automatvåpen og sprengstoff. Ett av flyene skal være ødelagt, ifølge lokale myndigheter.
– Flere eksplosjoner er hørt inne fra flybasen. Skuddvekslingen pågår fortsatt, sier en politioffiser til nyhetsbyrået AFP like før klokken 20.30.
En AFP-journalist så flammer og røyk stige opp fra flybasen. Basen er en av landets hovedbaser og brukes av marinen.
Osama bin Ladens støttespillere har flere ganger varslet å hevne drapet på den tidligere Al Qaida-lederen.