I et intervju med Al Jazeera onsdag advarer han Syrias alawitter og ber dem ta avstand fra president Bashar al-Assad og endre sin tro om de vil beholde livet.
Nusrafronten har sammen med andre opprørsgrupper inntatt store områder i det nordvestlige Syria de siste ukene.
De har blant annet fått kontroll over byene Idlib og Jisr al-Shughour og dermed kommet nærmere kystområdene der det bor mange kristne og alawitter, og der Assads regjering fortsatt står sterkt.
– Vi vil fortsette å fokusere på Damaskus og på å styrte regimet. Jeg kan forsikre dere om at dette ikke vil ta lang tid, sa Abu Mohamad al-Golani i intervjuet, der han satt med ryggen til og ikke viste ansiktet sitt.
Imot både IS og regimet
Den sunnimuslimske Nusrafronten er den sterkeste grupperingen blant syriske opprørere som er imot både regimet og IS.
Advarselen til alawittiske landsbyer og hans uforsonlige språkbruk vil gjøre lite for å berolige Vesten og alawittene, som er en sjiamuslimsk sekt.
– Hvis de nedlegger sine våpen, tar avstand fra Assad, ikke sender sine menn for å kjempe for ham og returnerer til islam, er de våre brødre, sa han og la til at alawittene er en sekt som har «beveget seg ut av Guds religion og islam».
– Ikke krig mot de kristne
Golani sa også at Nusrafrontens krig er mot Assad og den libanesiske organisasjonen Hizbollah som støtter ham, og at de ikke er i krig med de kristne, som han hevdet de vil respektere om de tar avstand fra regimet.
Han gjorde det også klart at de ikke har planer om å bruke Syria til angrep mot Vesten, selv om alle muligheter er åpne om USA fortsetter å angripe dem.
Han sa ingenting om meldinger om enkelte golfstater som Qatar har vært i kontakt med Nusrafronten for å få dem til å bryte med al-Qaida og danne en ny gruppering som golfstatene kunne støtte.
- LES OGSÅ: Storoffensiv mot IS i Palmyra