Netanyahus kontor ville først verken bekrefte eller benekte meldingen som først kom fra israelsk radio, men statsministeren leste senere tirsdag opp brevet i nasjonalforsamlingen Knesset.
– Vi har mottatt brevet og vil gå igjennom det, sier en kilde i Det hvite hus til nyhetsbyrået AFP.
Pollard var analytiker i den amerikanske marinen. Han soner en dom på livsvarig fengsel for å ha overlevert tusener av dokumenter om amerikansk etterretningsvirksomhet i araberverdenen til Israel fra mai 1984 til november 1985, da han ble arrestert.
Ber om nåde
I brevet ber Netanyahu om nåde for Pollard.
– Herr president! På vegne av Israels folk skriver jeg for å be om nåde for Jonathan Pollard. Da han ble arrestert, opptrådte Jonathan som agent for Israels regjering, leste Netanyahu på hebraisk.
– Selv om Israel på ingen måte rettet sin etterretning mot USA, var handlingene feilaktige og fullstendig uakseptable. Israel vil fortsette å overholde sine løfter om at slike feilaktige handlinger ikke vil bli gjentatt, sa han videre.
Israelske ledere har også ved flere tidligere anledninger reist spørsmålet om å få satt Pollard fri, men ingen president har vært villig til oppheve dommen.
25 år
– Mange er enige
Netanyahu henviser i brevet til at Pollard har sonet 25 års fengsel nå, og at det derfor er riktig med en ny benådningssøknad.
Han skriver også at mange velinformerte og ledende amerikanere er enige med ham i søknaden, inkludert flere kongressmedlemmer.
Da Pollard ble arrestert utenfor Israels ambassade i Washington i 1985, sa myndighetene at det hele var en uautorisert operasjon utført av en frynsete etterretningsgruppe. Men i 1996 fikk Pollard israelsk statsborgerskap og i 1998 innrømmet myndighetene at han var israelsk spion. Israelske myndigheter sier at de siden da har unngått å drive etterretningsarbeid i USA.