Ingen andre kilder har så langt bekreftet beskjeden fra Boko Haram, som nå meldes av BBC.
– Vi kunngjør vår troskap til muslimenes Kalif, Ibrahim ibn Awad ibn Ibrahim al-Husseini al-Qurashi, sa stemmen i lydopptaket.
Qurashi er mest kjent som IS-lederen Abu Bakr al-Baghdadi.
Har bånd til flere grupper
Den islamske staten (IS) har etter alt å dømme ikke så langt sendt ut meldinger om at de to gruppene slår seg sammen.
IS har allerede bånd til flere andre grupper i Nord-Afrika og i Midtøsten.
IS-lederen aksepterte i november i fjor løfter om lojalitet fra jihadister i Egypt, Libya, Algerie, Jemen og Saudi-Arabia.
Grupper i Afghanistan og Pakistan kunngjorde i januar at de vil danne en egen IS-provins.
Den nigerianske gruppen Boko Haram sitt forsøk på å danne et islamistisk styre nordøst i landet begynte i 2009. Flere tusen mennesker har siden mistet livet og mer enn halvannen million mennesker er på flukt.
Selvmordsangrep
Boko Haram kjemper nå for å vinne kontroll over byen Maiduguri, der gruppen først ble dannet som en religiøs bevegelse.
Minst 58 personer mistet livet i flere selvmordsangrep i Maiduguri lørdag. Opp mot 160 personer ble skadet. Flere av ofrene var barn. I tillegg eksploderte en bilbombe like utenfor byen.
Boko Haram har ikke tatt ansvar for angrepene, men har tidligere brukt selvmordsbombere.