Det opplyser laget i en pressemelding tirsdag kveld.
NRK har tidligere skrevet at Katjusja likevel kunne bli straffet for sin andre dopingsak på tolv måneder av MPPC.
Det internasjonale sykkelforbundet (UCI) ga ikke straff fordi saken gjaldt dopet kokain, men MPCC mente type stoff ikke har noe å si.
– Det er viktig for oss å være nådeløse. Sykkelsporten har hatt Festina-skandalen, Lance Armstrong-skandalen og flere andre saker som har skadet sporten sitt omdømme, sa MPCC-president Roger Legeay til NRK.
– Vanskelig posisjon
Nå svarer altså Katjusja med å trekke seg.
– Vi vil understreke at vi vil fortsette å kjempe mot doping med alle midler, heter det i pressemeldingen.
Katjusja forklarer at de ble medlem av MPCC i 2013, da «sykkelverden trengte å sende en klar beskjed om behovet for en ren idrett etter en rekke dopingskandaler».
– Nå er Katjsuja i en veldig vanskelig posisjon: på en side bestemte UCI seg for å ikke suspendere laget etter sakene til Luca Paolini og Eduard Vorganov, men samtidig mener MPCC at en suspensjon likevel er nødvendig etter deres regler, står det i pressemeldingen.
Kaggestad: – Feigt
Ifølge MPCC sitt regelverk må et lag som får to dopingsaker i løpet av tolv måneder ilegge seg selv åtte dager suspensjon fra ritt.
Suspensjonen skal starte umiddelbart etter en B-prøve eventuelt er positiv.
Det betyr at Katjsuja, med Kristoff og Sven Erik Bystrøm, risikerte å miste en av vårklassikerne.
TV 2s mangeårige sykkelkommentator Johan Kaggestad reagerer sterkt på at Katjusja velger å bryte med MPCC.
– Det er feigt siden de tenker mest på sin kortsiktige gevinst, sier Kaggestad til NRK.
– Katjusja hadde stått sterkere ved å stå sammen med de andre lagene for å styrke omdømme i sykkelsporten. Jeg synes det er synd at de ikke vil bidra, sier sykkelkommentatoren.
Katjusja er ikke det første laget som bryter med MPCC, og nå er det «bare» åtte World Tour-lag med (se faktaboks).
Bruddet får heller ingen konsekvenser for profflaget.
– De (MPCC) er i ferd med å miste sin posisjon som organisasjonsenhet for å påvirke sporten i positiv retning, mener Kaggestad.