Det melder FIFA selv på sine nettsider torsdag kveld.
Forbundet skriver i en kort melding at det er blitt oppmerksom på flere påstander angående Valckes opptreden, og forbundet har bedt sin etiske komité om å etterforske saken videre.
Avviser billett-påstander
Nyheten kommer etter at The Guardian hevdet at Valcke har vært med på å selge VM-billetter i 2014 til over markedsverdi. Generalsekretæren skal ha vært med på å dele overskuddet, men Valcke nekter for påstandene, skriver avisen.
Påstandene kommer fra en konsulent i et firma som inngikk avtale med FIFA om billett-salg. Kontrakten ble senere opphevet.
Nå vil imidlertid FIFAs etiske komite, med Cornel Borbely i spissen, undersøke anklagene nærmere.
54 år gamle Valcke har siden 2007 vært høyre hånd til den skandaleombruste FIFA-presidenten Sepp Blatter, som er blitt tvunget til å love å trekke seg fra stillingen.
Flere anklager
Det er imidlertid ikke første gang det blåser rundt Valcke. I 2011 ble det kjent at han hadde en mistenkelig e-post-korrespondanse, som skjøt ny fart i korrupsjonsanklagene rundt Qatar-VM.
Tidligere fotballpresident Sonde Kåfjord var blant dem som var overbevist om at saken skulle velte Valcke.
FIFA har hatt en rekke korrupsjonsskandaler, og i mai ble sju høytstående FIFA-ledere pågrepet i Zürich rett før FIFA-kongressen. De er blant 14 personer som er siktet i USA for korrupsjon i forbindelse med TV- og markedsrettighetsavtaler.