AaFK mener Liverpool-stjernen skylder klubben i overkant av 300.000 kroner.
Samtidig venter spillerens agent og mor, Berit Riise, på en overføring på mellom 800.000 og 900.000 kroner fra Aalesund, skriver Sunnmørsposten.
John Arne Riise jublet under landskampen, men krangler om penger med gamleklubben.
Onsdag koblet hun inn NFF i saken.
Bakgrunnen for feiden skriver seg tilbake til 1996: da AaFK og Riise skrev en kontrakt som skulle sikre spilleren 10 prosent av summen 1. divisjonsklubben ville få ved framtidige overganger.
Ved overgangen til Monaco fikk Riise et lån fra AaFK på 350.000 kroner som skulle hjelpe ham i gang.
Uenighetene startet da Riise ble solgt til Liverpool.
Aalesund mener Riise ga avkall på 10-prosentavtalen for at klubbskiftet skulle gå i orden.
Dette avviser Berit Riise.
- Jeg har fått i oppdrag fra John Arne å kreve inn de pengene AaFK skylder, sier hun til Sunnmørsposten.
Hun forteller at beløpet er i underkant av en million kroner.
- Det hun sier og skriver tar jeg med knusende ro, sier daglig leder Henrik Hoff i Ålesund Fotball AS.
Han står fast ved at det foreligger en avtale om at Riise ga fra seg de 10 prosentene han hadde krav på ved overgangen til Liverpool.