Fabio Capello kunne puste lettet ut etter 90 spilte minutter i Podgorica fredag.
England er klar for EM i 2012, men levde svært farlig mot et Montenegro-lag som hadde full kontroll etter pause.
Wayne Rooney gjorde det heller ikke bedre ved å på tåpelig vis bli utvist etter 74 minutter slik at lagkameratene måtte avslutte med 10 mann.
Pangstart for Capellos menn
Det startet svært bra for England mot laget de bare klarte 0-0 mot på hjemmebane i starten av EM-kvalifiseringen.
Theo Walcott fikk enormt rom på høyresiden og stilte inn siktet på Ashley Youngs pannebrask. Manchester United-vingen kunne enkelt stange gjestene i ledelsen for åpent mål etter 11 minutter.
Drama 20 minutter senere var det Young som var servitør etter flott klikk-klakk-fotball av England.
Han spurtet seg fri på venstrekanten og slo inn til en ledig Darren Bent som trillet ballen over målstreken uten å anstrenge seg nevneverdig.
Sjokkopphenting
Men like før pause fikk hjemmesupporterne et lite håp om en sjokkopphenting. Elsad Zverotic fikk ballen i feltet, snurret rundt og dunket inn 1-2.
England slet med spillet og rotet mye på midtbanen i annen omgang. Bedre ble det ikke da en sur Rooney tabbet seg ut drøye kvarteret før slutt.
Spisstjernen sparket til Miodrag Dzudovic bakfra etter å ha mistet ballen og ble sendt rett i dusjen. Kortet betyr at han må stå over minst en av kampene i neste års EM-sluttspill.
Montenegro sikret 2.-plass
Vertene presset enormt mot slutten og fikk uttelling ett minutt ut i tilleggstiden.
En høy ball ble slått inn i feltet, og innbytter Andrija Delibasic stupte fram og fikk skallet ballen inn til 2-2.
Heldigvis for England kom utligningen litt for sent for Montenegro, som med seier ville tatt gruppeteten med tre poeng i siste kamp mot Sveits.
Samtidig fikk Montenegro en hjelpende hånd av Wales, som noe overraskende tok seg av sveitserne med 2-0 på hjemmebane.
Aaron Ramsey sendte vertene i føringen på et straffespark etter 60 minutter, mens Gareth Bale doblet ledelsen ti minutter senere.
Det betyr at Montenegro er garantert 2.-plassen i gruppe G og omspill om EM-plass, mens Sveits blir liggende som treer.