27-åringen kjørte lenge alene i et brudd og holdt greit unna. Etter vel fem og en halv time på sykkelsetet kunne søramerikaneren juble.
– Dette har vært en fantastisk dag. Jeg vil takke familien min. Mot slutten tok feltet mye innpå, men det gikk bra, sa Rubiano.
Italieneren Adriano Malori overtok ledelsen i sammendraget før den sjuende etappen.
ganske tidlig på fredagens etappe. Dermed er hans Giro d'Italia over for denne gangen.
– Jeg hadde ikke noe annet valg. Det gikk bare tungt. Jeg får sette meg ned med lege og laget mitt å se på dette. Jeg vet ikke hva det er, sier Hushovd til NTB.
Den norske duoen Alexander Kristoff (Katjusja) og Gabriel Rasch (FdJ) fortsetter rittet.
Det avsluttes i Milano 27. mai.
Resultater:
6. etappe, Urbino - Porto Sant'Elpidio (210 km):
1) Miguel Angel Chavez Rubiano, Colombia (Androni Giocattoli) 5.38.30, 2) Adriano Malori, Italia (Lampre) 1.10 min. bak, 3) Michal Golas, Polen (Omega) s.t., 4) Alexander Djatsjenko, Ukraina (Astana) s.t., 5) Cesare Benedetti, Italia (Netapp)
s.t., 6) Daryl Impey, Sør-Afrika (Orica) 1.51., 7) Filippo Pozzato, Italia (Farnese Vini) s.t., 8) Fabio Sabatini, Italia (Liquigas) s.t., 9) Francisco Ventoso, Spania (Movistar). s.t., 10) Michal Kwiatkowski, Polen (Omega) s.t.
Norsk: 173) Alexander Kristoff (Katusja) 23.53, 174) Gabriel Rasch (FDj) s.t.
Thor Hushovd (BMC) brøt.
Sammenlagt:
1) Malori 20.25.28, 2) Golas 0.15 min. bak, 3) Ryder Hesjedal, Canada (Garmin) 0.17, 4) Rubiano 0.30, 5) Christian Vande Velde, USA (Garmin) 0.32), 6) Joaquin Rodrigez, Spania (Katusja) 0.36, 7) Peter Stetina, USA (Garmin) 0.37, 8) Daniel Moreno, Spania (Katusja) 0.39, 9) Enrico Gasparotto, Italia (Astana). s.t., 10) Luke Roberts, Australia (Saxo Bank) 0.41.
Norsk: 142) Kristoff 22.28, 164) Rasch 29.32.