Saif al-Islam Gaddafi oppholder seg nå i området sør for Ghat, nær Libyas grenser til Niger og Algerie, sier kilden til nyhetsbyrået Reuters.
– Han har fått tak i et falskt pass fra området Murzuq, sier kilden.
Muammar Gaddafis tidligere etterretningssjef Abdullah al-Senussi er involvert i organiseringen av fluktforsøket, tilføyer han. NTC skal ha blitt tipset om fluktplanene av andre etterretningskilder.
Ifølge Reuters' kilde er det så godt som umulig å forpurre planene.
– Regionen er veldig, veldig vanskelig å overvåke og omringe. Det er en ørkenregionen med mange fluktruter.
Les også:
Begravelse i ørkenen
Saif al-Islam er den eneste av Muammar al-Gaddafis sønner som fortsatt er på frifot i Libya. To av Gaddafis sønner har fra før reist til Algerie og én til Niger, mens tre av sønnene er drept.
Muammar al-Gaddafi ble selv drept under uklare omstendigheter idet han ble fanget under et forsøk på å flykte fra hjembyen Sirte torsdag.
Liket etter den styrtede lederen har de siste dagene ligget på utstilling i et kjølerom i byen Misrata. Nå er liket flyttet til et hemmelig sted, og tirsdag skal Gaddafi gravlegges, ifølge en tjenestemann i NTC.
– Det vil være en enkel seremoni med sjeiker til stede. Det vil skje på et hemmelig sted i ørkenen, sier kilden til Reuters.
Ifølge tjenestemannen må Muammar Gaddafi gravlegges nå fordi liket har begynt å råtne.
NTC skal ha vært i forhandlinger med Gaddafis stamme i Sirte om en overlevering av liket, men uten at det ble oppnådd enighet.
Trolig vil liket nå bli lagt i en anonym grav i stedet.
Les også:
Harde forhandlinger i vente
Drapet på den 69 år gamle eksdiktatoren markerte slutten på en åtte måneder lang borgerkrig i Libya, og søndag erklærte NTC offisielt at Libya var frigjort.
Men omstendighetene rundt drapet viser også hvor svak evne NTC har til å kontrollere de væpnede gruppene i landet.
Samtidig går overgangsrådet nå ei tid med vanskelige politiske forhandlinger i møte.
– Ledere i forskjellige regioner og byer vil nå forhandle om alt, seter i regjeringen, kommunebudsjetter, avvæpning av militser, sier en tjenestemann i NTC.
Men dette er bare et sunt uttrykk for den nyvunnede friheten i landet, mener tjenestemannen.
– Er det ikke dette som er demokrati?
Les: