De 17, flere av dem barn, ble drept i kamper rundt delstatshovedstaden Kadugli torsdag, skriver nyhetsbyrået SUNA.
Ifølge SUNA var det opprørere fra den nordlige grenen av den sørsudanske SPLA-geriljaen som sto bak angrepene. Opplysningene er ikke bekreftet fra uavhengig hold.
Sør-Kordofan forble under nordsudansk administrasjon da Sør-Sudan ble selvstendig i juli. Men mange av innbyggerne i delstaten kjempet på Sør-Sudans side under den 22 år lange borgerkrigen med nord.
- LES OGSÅ: Går mot full krise i Sør-Kordofan
Sudans president Omar al-Bashir erklærte lørdag også unntakstilstand i en annen omstridt delstat, Blånilen, og sparket delstatens folkevalgte guvernør Malik Agar. I stedet ble en militær guvernør innsatt.
Agar er lederen for SPLM-partiet i delstaten, som i likhet med Sør-Kordofan grenser til Sør-Sudan. Også her ønsker store deler av innbyggerne å tilhøre Sør-Sudan.