Ifølge dokumentaren var pave Benedikt XVI innblandet i et systematisk forsøk på å holde katolske presters misbruk av barn hemmelig.
Romersk-katolske prester fra England og Wales karakteriserte dokumentaren som ble vist på BBC søndag som «feilaktig og villedende».
Vatikanet har ikke ønsket å kommentere saken, men har uttrykt full støtte til uttalelsen erkebiskopen av Birmingham Vincent Nichols skrev på vegne av britiske biskoper.
– Dårlig journalistisk arbeid
Nichols sa at BBC «burde skamme seg over standarden på det journalistiske arbeidet som er lagt ned for å lage dette uberettigede angrepet på pave Benedikt XVI.»
BBC forsvarer dokumentaren som undersøkte omstendighetene rundt et hemmelig dokument skrevet i 1962 om hvordan biskoper skulle forholde seg til beskyldninger om misbruk av barn.
Dokumentet inneholdt en kodeks om hemmelighold som ble håndhevet ved bannlysing, ifølge dokumentarprogrammet BBC Panorama.
Ifølge dokumentaren håndhevet paven, tidligere kjent som kardinal Joseph Ratzinger, dokumentet i over 20 år.
– Villedende
Biskop Nichols sa i sin uttalelse at dokumentaren setter søkelyset på tilfeller der prester har misbrukt barn, og understreket at det er et problem som den katolske kirke har tatt på alvor.
«Denne delen av programmet er feilaktig og fullstendig villedende. Den er feilaktig fordi den fremstiller to Vatikan-dokumenter galt og fordi de blir brukt villedende for å knytte grusomhetene ved misbruk av barn til paven», skrev Nichols.
Dokumentene ble kjent for offentligheten i 2003.