To familier og flere titalls unge jøder som støtter dem, hadde forskanset seg i to hus i et tidligere palestinsk markedsområde.
Sikkerhetsstyrkene måtte bryte opp dører og foretok arrestasjoner mens det ble kastet steiner og egg på dem.
Fire ungdommer ble arresteret og 37 mennesker ble skadd i aksjonen, som varte i fire timer.
Etter aksjonen ble bosetterne satt på en buss og kjørt ut av området.
- Husene måtte tømmes, ifølge en rettsavgjørelse tidligere i uken, sa en politimann.
Omkring 30 israelske soldater ble i går dømt til 28 dagers fengselsstraff for å ha nektet å være med på å fjerne bosetterne.
Støre: Resultat av ny kontakt
Utenriksminister Jonas Gahr Støre er nå i Midtøsten for å snakke med israelske og palestinske ledere.
Han tror at aksjonen er et resulat av ny kontakt mellom israelere og pelestinere.
- De ulovlige bosettingene er noe statsminister Ehud Olmert i lengre tid har sagt han vil ta fatt i, påpeker han.
Han mener også at aksjonen er uttrykk for Olmerts ønske om å vise handlekraft.