Det er første gang paven for alvor tar opp spørsmålet om abort som er blitt et omstridt tema for katolikker i land som USA, Italia og Mexico.
Da han ble spurt av pressen om han støtter mexicanske biskoper som truer med å bannlyse politikere som stemte for å gjøre abort lovlig i Mexico by, svarte han et klart ja. Han insisterte på at livet begynner ved befruktninger, og at det å drepe et ufødt barn er uforenlig med å motta nattverden.
Vatikanets talsmann, Federico Lombardi, forsøkte senere å tone ned pavens utsagn ved å gjøre det klart at paven selv ikke hadde gitt ordre om å bannlyse noen.
Paven ble mottatt av president Lula da Silva da han kom til Brasil og av store menneskemengder da han reiste gjennom São Paulos gater i sin spesiallagde bil på vei til São Bento-klosteret, der ytterligere tusener ventet på ham.
Taper terreng
Men den fem dager lange reisen til Brasil skjer mens kirken er stadig mer bekymret over å tape terreng i Latin-Amerika, der nesten halvparten av verdens 1,1 milliarder katolikker bor.
Mange millioner latinamerikanere har de siste tiårene forlatt kirken og gått over til evangeliske protestantiske kirker som pinsevennene og amerikanske sekter.
Den katolske kirkens motstand mot prevensjon, abortrettigheter og sex utenfor ekteskapet har bidratt til å så tvil om den i brede lag av folket. I Brasil har den katolske kirken i de siste årene tapt 10 prosent av sine medlemmer.
Kritikk fra Lula
Også i Brasil er abort et hett tema. Like før paven kom til landet, kritiserte president Lula da Silva kirkens posisjon.
Lula sa at abort er offentlig helsespørsmål fordi mange brasilianske kvinner dør etter hemmelige, ulovlige og farlige aborter. Helseminister José Gomes Temporão ønsker en folkeavstemning om saken.
Det fikk presidenten i Brasils bisperåd, Geraldo Majella, til å beskylde regjeringen for å fremme en lettlivet seksualmoral.
Temporão svarte med å si at han vil ha kvinnene med i debatten fordi det i dag er menn som lager lovene, mens kvinner er ofrene.
– Dessverre er det ikke menn som blir gravide. Ellers hadde dette spørsmålet vært løst for lenge siden, sa han.
Sosialt ansvar
I løpet av besøket skal paven holde hovedtalen på en konferanse for latinamerikanske og karibiske biskoper i byen Aparecida om hvordan man kan stanse strømmen av troende som forlater kirken.
Mange prester ønsker også ledelse fra kirkens side om sosialt ansvar i et kontinent preget av fattigdom og klasseskiller.
Paven har lovet at han vil prioritere de fattige, de unger og urbefolkningen. Han har tidligere sagt at latinamerikanske prester bør ta opp sosiale spørsmål, men ikke blande seg inn i politikk.
Men nettopp Vatikanets kritikk av de såkalte tredjeverdenprestene som tok radikale politiske standpunkt mot undertrykking og økonomisk utbytting, har også bidratt til at kirken har tapt respekt blant de fattige.