Styret i banken stemte sju mot en for å senke renten til et nivå som er enda lavere enn det rekordlave rentenivået i USA etter at sentralbanken foretok et drastisk kutt.
Det hersker imidlertid tvil om rentesenkingen vil få noen effekt når den allerede lå så nær null som den gjorde.
Tidligere fredag opplyste den japanske regjeringen at den venter nullvekst neste år etter at å ha nedjustert forventet vekst fra 1,3 prosent. I år ligger Japan an til nedgang i BNP.
Rentekuttet har foreløpig ikke hatt noen oppmuntrende vikrning på Tokyo-børsen. Da handelen ble avsluttet, hadde Nikkei-indeksen falt med 0,91 prosent.
Investorer er bekymret på grunn av nedgang på New York-børsene, samt tall som tyder på at Japan ikke vil oppleve økonomisk oppgang før i tidligst i 2010.